女性在有巧克力囊肿的情况下，取卵时可能会刺破巧囊，但是几率比较低，所以不用过于担心。从临床医学来讲，巧克力囊肿又叫做卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。在临床实验中，取卵会对人体产生影响，例如卵巢损伤、盆腔炎等。因此，这里建议取卵后身体有异常情况的话，及时告知给医生。
取卵时把巧克力囊肿破裂后，应该进行手术治疗，手术治疗可以直接将破裂后，囊肿内的液体清理干净，以防止引起腹部炎症，同时还可以将巧克力囊肿直接剥离干净，以防止复发。还可以使用促性腺激素释放激素类似物来治疗，能阻止巧囊炎性物质到处传播，但是治疗时间比较长，大概要三个月到半年。
取卵时巧囊穿了会污染卵子吗？
取卵时把巧囊穿刺了对卵子不一定会造成污染，但是也不一定。：巧克⼒囊肿属于⼦宫内膜异位症的⼀种，是影响怀孕的因素之⼀，可能会影响排卵、卵⼦质量、盆腔环境。⼀般有巧克⼒囊肿的话，可能会选择超长⽅案促排卵，对巧克⼒尽量的抑制，减少巧囊的体积，降低对卵⼦、胚胎和盆腔环境的影响。
巧囊取卵会感染吗？
取卵时可能造成巧囊感染，卵巢囊肿穿刺以后，在穿刺口会有破口，破口就会有囊液的外溢。穿刺取卵的影响很大，会出现腹痛、腹胀、下腹坠痛、肛门坠胀等。因此，在做巧囊的穿刺，就需要在腹腔镜的监护下去做穿刺。因为腹腔镜可以边看边穿刺，把穿刺口周围流出来的液体，避免流入腹腔。
